骐骥生物公司发布数据分析软件Qi MetA

重庆时时彩走势图-时时彩走势图_时时彩龙虎合稳赢技巧http:www.cpoha.com.cn  2018-09-11 11:10  未知 养生编辑 我要投稿
北京骐骥生物技术有限公司的数据处理团队贴近质谱应用场景,根据数据分析的具体需求,研究质谱用户的使用逻辑,开发出了Qi MetA数据分析软件的一站式分析平台。
相关关键词导读  骐骥生物公司 QiMetA

 

骐骥生物公司发布视窗化的数据分析软件Qi MetA
骐骥生物公司发布视窗化的数据分析软件Qi MetA

     随着多层次的组学包括代谢组学的研究展开,高通量的数据收集已经可以实现,但是与其他的组学学科相似,代谢组学的数据分析仍是个问题,但更大的问题是如何从庞大的数据中筛选出真正有价值的数据,以及代谢组学数据集到底意味着什么。因此数据的挖掘以及场景化分析已经成为各领域学者和用户面对生物学研究,特别是代谢组学研究的最大瓶颈。 

 

骐骥生物公司发布视窗化数据分析软件Qi MetA
骐骥生物公司发布视窗化数据分析软件Qi MetA

    北京骐骥生物技术有限公司的数据处理团队贴近质谱应用场景,根据数据分析的具体需求,研究质谱用户的使用逻辑,开发出了Qi MetA数据分析软件的一站式分析平台。骐骥生物联手Waters公司(沃特世公司纽约证券交易所代码:WAT)正式推出这款视窗化的数据分析软件。

 

Qi MetA软件特色介绍
Qi MetA软件特色介绍

Qi MetA软件特色介绍:

Qi MetA是一个视窗化的数据处理和分析软件, 应用于代谢组学和临床数据的分析,但功能也可以扩展到生物学数据分析和可视化的多个方面。适合于一站式代谢组学分析、临床数据分析,以及单独的生物学项目分析。它独有的特点和功能主要包括:

首先,可以直接应用Waters公司Progenesis QI软件导出的数据,直接进行处理,获得可供分析的标准化数据;自动进行以质控样本QC为标准的数据筛选,包括0值筛选,变异系数CV筛选和LOESS回归校正,并自动提供样本和QC的主成分分析(PCA)分布情况,从而对数据质量进行有效控制与评估;

其次,软件不仅可以获得单因素下两组数据差异分析所有统计学指标,更可以进行多组的比较,得到整体的p值以及每两组间的p值;

第三,Qi MetA针对单变量进行回归分析,同时可以批量针对所有变量进行R2筛选;

第四,使用HMDBLIPIDMAPS完整数据库对化合物进行分类和比例变化分析;

第五,提供两组或多组(正交)最小二乘法判别分析((O)PLS-DA)的快速切换;(O)PLS-DA 提供置换检验(permutation)结果以及交叉验证功能(cross-validation)用以评判模型是否过拟合;

第六,通过VIP值、p 值、校正p值(FDR)及组间倍数变化(fold change)的阈值设定,一步法获得潜在生物标志物;

第七,在软件中,可以自动或者手动快速建立:逻辑回归(logical regression),决策树(decision tree,随机森林(random forest,支持向量机(support vector machine),GBMgradient boosting machine)以及Bagging模型;自动或者手动给出以上各种模型的ROC曲线以及模型评价参数;对潜在的生物标志物组合提供7种可选模型,并同时可以进行4种模型ROC和评价;

第八,Qi MetA针对不同场景,不仅可处理代谢组学和脂质组学等组学数据,同时也可以处理临床数据和其他生物学数据;每次分析按照项目分类,历史记录查询以及断点工作继续非常方便;浏览、处理、浏览、处理 …… 透明化的流程使结果更加可信。

Qi MetA软件未来的发展:

Qi MetA软件的发布,是我们事业的第一步,也是我们和Waters共同探索和挖掘数据价值的开始。未来,我们会在Qi Meta的数据分析平台上,开发更多的场景化应用,更深入探究数据价值,提供更有效的数据解决方案,包括:

    第一,数据前处理的功能拓展,可以独立于QI软件进行数据前处理,包括峰对齐(peak alignment),峰注释(peak annotation),化合物鉴定(compound identification),个性化数据库的建立等等。

第二,生物学功能的深入阐述。未来软件不仅给出数据分析的结果,还最大程度的将其生物学意义进行阐述,例如进行信号通路分析(pathway analysis),让用户更便捷的掌握数据后面的科学意义。

第三,展开生物知识图谱的研究。提供目标代谢物或者目标分子的相关信息扩展功能,当用户通过一系列筛选得到目标化合物后,可以快速得到与该化合物相关的完整信息,有助于其下一步研究和应用的快速推进。

waters公司的合作:

基因测序以及质谱分析作为能解释“这是什么”的两大工具已经深入到科学研究,特别是生物学研究的各个领域。Waters公司专注于为实验室相关机构开发和生产先进的分析和材料科学技术。50多年来,Waters公司开发出一系列分离科学、实验室信息管理、质谱分析和热分析技术。Waters公司为高通量数据提供创造工具,同时也致力于推动质谱数据分析的不断更新和进步。Qi MetA软件无缝对接Waters的代谢组学工作,通过这次的合作,骐骥生物未来将携手Waters服务全球更多的用户,并推动组学数据分析更高效,更全面,更便捷。

总结:

在这成熟的金秋,骐骥生物收获了丰硕的果实--Qi MetA软件。Qi MetA 作为一款个性化的数据分析和挖掘软件,得到了Waters公司的鼎力支持,以及同行、专家、学者的帮助,大家的认可和鼓励,也给我们继续向前的信心。通过这个数据平台,我们未来有信心提高代谢病分析水平,更有效地进行疾病的早期检测与临床诊断,最终成为精准医疗和智能诊断的开拓和先驱者。

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